MRSA törzsek járványügyi tipizálása multiplex PCR alapú eljárással: SCCmec típusok meghatározása
Kórházi fertőzések során izolált MRSA (MRSA: methicillin rezisztens Staphylococcus aureus) törzsek járványügyi vizsgálata; a klinikailag összefüggő esetek (legalább kettő) közötti járványügyi összefüggés igazolása vagy kizárása (terjedés betegről betegre, betegből környezetre majd újabb betegre).
Az SCCmec kazetta strukturális típusának meghatározása. A kapott PCR mintázat alapján meghatározott típusról (SCCmec típus) a beküldőt, valamint ha ettől különböző, az illetékes járványügyi szakembert leletben tájékoztatjuk <Csoportos mikrobiológiai lelet PCR alapú járványügyi tipizáló vizsgálatokhoz> - eljárás leírás OMR melléklet.
A vizsgálat elve az MRSA törzsek obligát kazettájának (SCCmec) strukturális különbségeinek kimutatása a vizsgálandó szekvenciák megsokszorozásával multiplex PCR reakcióban, a keletkezett termékek molekulasúly szerinti szétválasztása horizontális elektroforézissel, majd detektálásuk ethidiumbromiddal való jelölés után (UV fényben láthatóvá válik a jelölt DNS). A kapott termékek száma és mérete egy mintázatot határoz meg (SCCmec típus), amelyet szem ellenőrzése mellett softver segítségével értékelünk és tárolunk.
Multiplex PCR: polimeráz láncreakció, a keresett szekvenciák specifikus, kettőnél több oligonukleotid párral történő enzimatikus megsokszorozása a detektálhatóság határának elérése érdekében.
SCCmec: Staphylococcus chromosomal cassette mec (staphylococcusok mecA gént hordozó kazettája)
|