Kiemelt témák 

I.      Veszélyes fertőző betegségek hazai előfordulása, diagnosztikája

II.      HIV, AIDS magyarországi előfordulásának tanulmányozása

III.      Influenza hazai alakulása

IV.     Zoonózisok hazai jelentőségének vizsgálata

V.      Nozokomiális infekciók surveillance-ja

VI.      Antibiotikum rezisztencia genetikai hátterének és terjedésének vizsgálata

VII.     Védőoltással megelőzhető fertőző betegségek

VIII.     A lakosság egészségi állapotának monitorozása

IX.      Hepatitis vírusok molekuláris epidemiológiája

X.       Krónikus vírusfertőzések

Egyéb