Járványügyi tipizálás PCR alapú eljárással: ERIC1, ERIC2 primerekkel
Kórházi fertőzésekből valamint a kórházi környezetből esethalmozódás, járvány esetén kitenyésztett baktérium törzsek járványügyi vizsgálata. A klinikailag összefüggő esetek (legalább kettő) közötti járványügyi összefüggés igazolása vagy kizárása (terjedés betegről betegre, betegből környezetre majd újabb betegre).
Az ERIC repetitív (ismétlődő) szekvenciák számának és méretének meghatározása. A kapott mintázat alapján meghatározott típusról, altípusról (ERIC típus, altípus) a beküldőt, valamint ha ettől különböző, az illetékes járványügyi szakembert leletben tájékoztatjuk <Csoportos mikrobiológiai lelet PCR alapú járványügyi tipizáló vizsgálatokhoz> mintán.
A vizsgálat elve a baktériumok között széles körben elterjedt ERIC szekvenciák megsokszorozása PCR reakcióban, a keletkezett termékek molekulasúly szerinti szétválasztása horizontális elektroforézissel, majd detektálásuk ethidium-bromiddal való jelölés után (UV fényben láthatóvá válik a jelölt DNS). A kapott termékek száma és mérete egy mintázatot határoz meg (ERIC mintázat), amelyet szem ellenőrzése mellett szoftver segítségével értékelünk és tárolunk.
ERIC: enterobacterial repetitiv intergenic consensus sequences a bakteriális genomban sűrűn ismétlődő régió.
A vizsgálat eredményét, annak értékelését bemutató ábra:
a Képek menüpont alatt található. |